多表观遗传靶点筛选的高通量芯片分析
波维尔科学公司宣布应用注释描述了其染色质免疫沉淀(ChIP)分析技术的新96孔格式版本所取得的优异结果。
随着研究人员阐明通过体内蛋白质与DNA的动态结合来调控基因的原理,表观遗传学领域的发展正在迅速扩大。其中的关键是需要分析大量的高丰度和低丰度调控机制,以系统地绘制病原体/疾病刺激后蛋白质- dna的相互作用。
染色质免疫沉淀(ChIP)测定法用于研究这些相关性,历来受限于大样本数量、繁重的洗涤步骤,导致有价值的样本损失和低信噪比,再加上重复性差。这一新的应用说明详细介绍了chrorap®96 Pro-A的使用,一个96孔板,每个孔包含固相刚性多孔聚合物BioVyonTM,其中蛋白a与化学结合,允许在同一板上并行运行多达96个ChIP检测。
为了确定使用chrorap®96筛选多个表观遗传靶点的易用性、实验设计的灵活性和可重复性,我们在96孔板上同时对三个人类染色质样本(HepG2、HeLa和K562)中常见表观遗传标记(H3、H4、H3K4me3和RNA pol II)在三个感兴趣的基因靶点(GAPDH、β -珠蛋白和PABPC1)上的结合效率和使用情况进行了分析。应用说明详细描述了分析方法、数据解释和统计分析,以及使用新的chrorap®96高通量ChIP分析板的好处,包括多靶筛选、灵活的实验设计、可靠的重复性、高数据质量和自动化液体处理潜力。