莱斯特大学研究人员开发计算机系统扫描大组致命病原体

莱斯特大学科学家开发的创新计算机软件正在淡出新光线,说明应对脑膜炎和胃炎负责的致命病原体的遗传组成

软件称为'phomeit'快速扫描大组并识别相位变基因,同时比较所有这些基因这有助于理解一系列致命疾病的遗传过程

莱斯特大学研究者由遗传学和基因组生物学系Chris Bayliss博士领导,将软件应用到许多基因组序列中,供二组细菌-Neisseria Mengitidis(脑膜炎的重要原因)和Campyobcter Jejini(食源胃炎最常见的原因)使用研究发布在PLOS One和Microbial基因组学杂志上

Bayliss博士解释道:“我们和其他人预测深入分析这些大型基因组将揭示这些病原体如何适应人类和家禽宿主的生活,以及基因变化如何可能导致有害感染。”

现代脱氧核糖核酸排序技术现在产生大容量的'基因组'-生物整体遗传内容-信息多维生物-从人到微生物

在许多情况下甚至有太多数据无法用现有计算机软件有效分析

iblices应用适应环境压力和宿主压力机制之一是可逆交换或FT基因编码分子与宿主交互作用, Joe Wanford解释理工大学遗传学和基因生物系研究的博士生Joe Wanford

常住细胞表面(如喉咙内)发生紧密交互作用, 而OFF状态允许躲避宿主抗体最终可能导致细菌死亡其中一些被称为“相位变量基因”很容易识别,因为其DNA的具体识别特征,但直到现在还无法快速分析这些基因在多基因组间的存在分布。”

团队分析显示相位变基因大都分布于病原体(引起疾病)和同源体(生活在你身体中,不造成损害)细菌种类之间,但这些基因的存在或表达的微小差异可能在从原状分治人体向全发疾病过渡中起到作用。

实验室目前正在研究这些基因在疾病过程的具体作用

Bayliss博士补充道 : “ 我们相信新软件对分析数量不断增加的基因组序列至关重要,