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Sage-N研究的新的自动磷酸化工具提供更准确的磷酸化位点定位,帮助对抗疾病,如癌症

Sage-N Research Inc., (Sage-N)是计算蛋白质组学的世界领导者,宣布将第一个商业化的磷酸化工具利用质谱技术集成到其药物发现平台。新的磷酸化算法,基于哈佛医学院Steve Gygi教授开发的方法,衡量正确的磷酸化位点定位的可能性,这对许多疾病,如癌症的研究很重要。

翻译后修饰(PTMs)的分析对许多疾病的研究尤为重要。如果这些蛋白质修饰的调控发生变化,就可能导致阿尔茨海默病和癌症等疾病。在蛋白质相互作用中,磷酸化等PTMs被用作化学开关,因此,它们的识别是必不可少的,因为它导致深入了解蛋白质在生物系统中的功能和作用。它还有助于开发治疗这些难以治疗的疾病的新药物,而且由于所有新上市的药物中有三分之一是磷蛋白(激酶抑制剂),因此需要一种工具来确定一种蛋白质是否已经磷酸化,这是前所未有的必要。

Sage-N与第一个磷酸化算法ASCORE的开发者Steve Gygi密切合作,将该技术集成到其药物发现平台。该平台具有行业领先的后处理工具和新的Sorcerer Enterprise 4.0软件,提供对癌症和干细胞研究重要的低丰度磷蛋白和PTMs的最敏感和准确的识别和表征。

磷酸化算法不仅能确定合适的肽序列,还能提供有关位点决定离子存在与否的信息。Sage-N研究公司已经将该工具与SEQUEST 3G搜索引擎集成,后者是与斯克里普斯研究所的John R. Yates III教授合作开发的。磷酸化算法从SEQUEST 3G数据的结果产生一个基于概率的得分,该得分根据MS/MS光谱中位点决定离子的存在和强度来衡量正确磷酸化位点定位的概率。

现在,利用质谱蛋白质组学的多重评分,可以大规模地识别和表征蛋白质。标准的搜索引擎只能识别蛋白质的序列,但不能确定磷酸化位点是否正确。通过将新的磷酸化工具与SEQUEST 3G集成,该工具可以处理数据,并提供多个位点和一个概率评分,通过有效地分散不正确的肽谱匹配(psm),使数据灵敏度最大化。

Steve Gygi评论说:“Sage-N平台具有首个商业化的磷酸化工具,使研究人员能够在理解难以治疗的疾病方面取得进一步进展。这一创新的磷酸化工具对研究领域的发展和进展极其重要的细胞信号输入,如癌症。该算法通过处理搜索引擎的数据来找到磷酸化位点的具体位置,这在同类算法中尚属首次。”

Sage-N首席执行官David Chiang表示:“通过在我们的发现平台中集成这种磷酸化算法,并允许它与SEQUEST 3G和其他组件一起工作,包括全面服务的数据分析和存储,为研究人员提供癌症和干细胞发现的前沿工具和技术。它会让它们接触到那些低丰度的磷蛋白,我们认为这些蛋白在这些疾病中很重要。

这一进步表明,我们正在进化成为翻译蛋白质组学的“iPhone”的供应商,它功能强大,易于使用,并包含许多3理查德·道金斯先进蛋白质基础研究的政党应用。”

关于Sage-N Research, Inc.及其易于使用的蛋白质组数据分析解决方案,包括SEQUEST 3G和磷酸化算法,请访问www.sagenresearch.com

关于Sage-N研究公司

Sage-N Research, Inc.是全球领先的高通量蛋白质组学研究集成蛋白质组学平台供应商。业界领先的Sorcerer电器是即插即用的生产力系统,被世界范围内领先的生命科学研究人员使用,使用质谱数据快速准确地识别生物样品中的蛋白质和蛋白质修饰。该公司成立于2002年,是一家私人控股公司,总部位于硅谷中心的加利福尼亚州圣何塞。通过与领先的科学家和公司的战略合作,Sage-N研究公司在易用性、应用和技术方面推进了最先进的水平,实现了改变世界的生物学和医学发现。欲了解更多信息,请访问www.SageNResearch.com



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