Sage-N Research为桑福德-伯纳姆医学研究所优化数据生成
计算蛋白质组学领域的世界领导者Sage-N研究公司(Sage-N)今天宣布,Sanford-Burnham医学研究所(SBMRI),一家致力于寻找人类疾病治疗方法的私营非营利性研究机构,已经实现了Sage-N SORCERER Enterprise蛋白质组学平台。该公司将使用该系统来提高数据搜索的速度,并增加其蛋白质组学项目的数据生成,从凝胶带中的蛋白质识别到定量的总蛋白质组和总磷蛋白质组分析。
SBMRI的蛋白质组学设施提供基于液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)的蛋白质组学服务,以支持研究所的研究人员。近年来,该设施使用了各种搜索引擎进行数据库搜索,最近选择实现Sage-N Sorcerer Enterprise平台进行大规模分析。该设施之所以选择该平台,是因为它能够提供更高的准确性和吞吐量,同时也能够运行成功路径蛋白质组学研究所需的最严格的算法。此外,SOCERER企业是方便和易于使用的,使研究人员能够进行跨蛋白质组学管道(TPP)格式的搜索数据验证,这大大提高了设施的分析。
自从实施了SORCERER企业平台,SBMRI蛋白质组学设施已经提供了增强的搜索速度,提高了分析的准确性,并能够以多种格式导出数据。随着新算法的发展,该基金还受益于肽(包括磷酸肽)的改进识别。此外,采用了决策树MS/MS方法,实现了该平台的VersaSearchTM软件对这些数据文件提供了高质量的结果,其中包括碰撞诱导解离(CID)和电子转移解离(ETD)光谱。蛋白质组学设施的团队已经得到了全面的善后支持,并有机会与Sage-N的人员合作,为该平台开发改进的工具。
SBMRI蛋白质组学设施高级蛋白质组学主任Laurence Brill博士说:“SORCERER Enterprise是我们数据库搜索的首选引擎,它使设施内的后处理变得简单、快速和可靠。我们在实施后从Sage-N获得的支持是无价的,我们对团队帮助我们取得的成果感到非常兴奋。”
有关Sage-N Research, Inc.和SOCERER 2平台的更多信息,请访问www.SageNResearch.com
关于Sage-N研究公司
Sage-N Research, Inc.是为蛋白质组学研究提供集成数据设备(IDAs)的世界领导者。业界领先的SORCERER ida是即插即用的生产力系统,为世界领先的生命科学研究人员使用质谱数据快速、准确地识别生物样品中的蛋白质和蛋白质修饰。该公司成立于2002年,是一家私人控股公司,总部位于硅谷中心的加利福尼亚州米尔皮塔斯。通过与领先的科学家和公司的战略合作,Sage-N Research在易用性、应用和技术方面推进了最先进的状态,以实现在生物和医学领域改变世界的发现。