2022年4月4日至7日在贝尔法斯特微博学会年度会议上提供数据

英国基因组公司RevoluGen科学家合作者Quadram学院提供数据,Quadram团队结果显示Firemont高分子权提取DNA和多路牛津Nanopore排序的长处,以成本效益完全混合病原体基因组解析对急性和慢性Salmonella感染具有重要意义的基因组排列

微小核酸水平变异可影响抗生素抗药性, 整个代谢路径常通过短读脱氧测序解决, 细菌还可能显示基因组重排列, 大基因组分页移位和/或定向长线转序生成不同奇特基因组结构,无法通过短读顺序识别这种变异,因为长重数序列需要数万基对解析”。 NorwichQuadram学院微信组高级博士后科学家Emma Waters博士解释

在这次会议上,Wats博士展示了一张招贴^一号显示多路长读脱氧核糖核酸排序能力调查Salmonella插件关系与急性和慢性感染相关联使用RevoluGen火猴技术提取长长HMW脱氧核糖核酸促进了48倍测序和成功生成全集样本约30X理论覆盖HMW脱氧核糖核酸质量支持我们努力提高Oxford NanoporeMinion样本数,

单列招贴²由Luisa Bautista de Carvalho介绍,Quadram团队解决并调查Salmonella instevarTyphi结构染色体重新排列Typhi,因果代理 伤寒热, 重新使用脱氧核糖核酸提取 与RevoluGen的火猴包和长读排序S.Typhi重新排列可影响细菌代谢能力,促进人类宿主在某些环境条件下生存远程排序其他医学上重要的细菌病原体也可以从此方法中受益" Bautista de Carvalho女士总结

口试³Gemma Langridge博士、Quadram集团领袖和RevoluGen火猴技术早期应用者总结长读排序细菌的利弊多路长程测序的出现克服了这一问题,因为数千基数常生成,可跨长重复序列识别侧染色体脱氧核糖核酸,允许基因组结构变异识别GV可提供机制,使细菌快速适应新环境并需要常规评估并使用传统核素水平变异度测量法

RevoluGen受专利保护技术取自基于旋转列协议使用高g力提取HMW-DNAFiremonkey生成脱氧核糖核酸片段不短也不长对长程排序技术体积调整脱氧核糖核酸分解法提高技术总体排序结果,不浪费顺序资源读取小片少用或通过阻塞读孔太长减少顺序分解fimont为PacBio HiFi用户提供并行分片/解片协议选项,消除对耗时和耗资后分片工作流的需求,这些工作流需要实现最优结果所需要的非常紧凑的脱氧核糖核酸分布

Quadram和RevoluGen三年多来一直在数项脱氧核糖核酸测序项目中协同工作,RevoluGen是授予Quadram联合博士生奖学金的工业伙伴RevoluGen最近将其自动火猴系统机器人转至Quadram实现HMW脱氧核糖核酸提取自动化横跨两个高容量细菌排序项目:第一个项目将处理英国卫生安全局实验室采集的Salmonella样本第二组处理来自诺福克地区的Salmonella和Campylobcker样本,研究抗微生物抗药性等

变迁Gen投资12个多月实现FiremonkHMW脱氧核糖核酸提取为标准96well滤波板格式,世界首次自动提取库备妥长频HMW脱氧核糖核酸提取协议验证从细菌和哺乳动物样本提取并净化脱氧核糖核酸,与Quadram协作是公司首个客户推广

Gemma和Quadram团队合作脱氧核糖核酸排序和病原体基因组世界领先项目,

火猴很容易使用 快速像旋转柱包现在它可以多路自动化,可以例行改编支持大型短读基因组程序,这需要简单易用提取法,并仍然回溯到同样提取法补长读法,无需查找原生生物样本并重新提取HMW脱氧核糖核酸

英国卫生安全局科学家除使用Firemonk外,HMW脱氧核糖核酸提取是DNA排序流程中关键的第一步快速增长全球测序驱动需要自动化处理量样本应用如人口基因组学、流行病变异筛选和抗生微生物基因监控

讲解和招贴

1. 招贴画:48复数生成全集并判定基因组结构华特斯WinnieY.李阿米那伊斯梅尔艾哈迈德聊天卫和Gemma兰里奇
2. 招贴画:Salmonella Typhi聚居区经过基因组重新布局,Luisa Bautista de Carvalho,EmmaVWats和GemmaCLangridge
3. 陈述:Salmonella基因组重排列对基因表达式的影响EmmaV沃特斯连姆A塔克、雅那海斯、约翰温和Gemma兰里奇

关于变迁Gen

RevoluGen是一家私有科研开发公司,商业分子工具,特别注重从细胞中快速提取长纯脱氧核糖核酸碎片

卷积Gen核酸隔离净化产品在所有短程和长程脱氧核糖核酸排序技术中广泛应用,包括特别用于人口基因组学、流行病变异筛选和抗生微生物基因监测

firemonket通过提取长片脱氧核糖核酸并存大小选择函数来显著提高排序结果,协议内嵌入该函数以最小化小片脱氧核酸沾染独立使用火花大小选择协议可提高取出包产品分子比,输出与所有排序技术兼容

公司总部设在英国,研发、制造和直接客户销售支持RevoluGen服务世界客户并获取世界领先分子生物工具公司协议,包括MerckKGaa公司(销售公司)、Welgene公司(分发公司)、Cytiva公司(制造公司)、Tecan公司(航空公司)和A4P公司(物流公司)。

关于Quadram生物科学学院

Quadram研究所是一个跨学科研究中心,处于食品卫生研究新时代前列将研究人员和临床医生聚到一楼内并置置欧洲最大内镜检查单元和临床研究设施

Quadram研究所以Norwich研究园为基础,是Quadram研究所生物科学、Norfork和Norwich大学医院NHS基础信托公司、东安卓大学和生物技术生物科学研究理事会之间的伙伴关系

其使命是通过内脏健康、微生物学和食品创新提供更健康的生活,其愿景是理解食物和微生物如何交互促进健康和预防疾病

Quadram研究所生物科学互连研究主题提供植物、微生物、食品和健康研究流:食物链中的微生物内脏和微生物和食品创新