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批量创建实验工具数据转换器开源库

发布日期 : 2023年5月17日
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作者/源码: 座谈

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Allotrope平台伙伴支持行业标准并免费向科学界提供开源产业数据转换器库

研发云增强生物技术产业倡议在生物IT世界大会上启动科学界仪器转换标准化倡议公司努力有双重性:Benchling作为Allotrope基础伙伴网络的积极成员正在促进行业标准,并正在创建开源转换器库,该库将工具生成数据格式化为Allotrope简单模型标准帮助组织实施这些标准通过开放源码提供这些转换器,各种大小公司将能够很容易地在实验室内部和跨实验室实现仪器数据标准化和连接,最终驱动行业更多采用可查找、可访问、互操作和可复用数据

从事科研开发的每一公司无论大小,在将实验仪表数据整合到科学过程时都面临同组挑战。实验工具常生成专有数据,导致数据治理、标准化和连通性方面不必要的代价高昂障碍科学家被迫人工传输数据和管理定制数据管道,防止他们大规模使用数据,给IT和自动化团队增加负担并引入守规风险

业界领袖表示支持Benchling开源工具转换器主动

Allotrope基金会主席Corey Bakalski表示:「今日新闻显示产业集体实现研发FAIR数据目标的进展”。Allotrope今年发现一个重要的里程碑,使用Allotrope简单模型发布公开数据标准,知道存取易用对驱动标准化至关重要提供创新公开工具将标准化为行动

实验器数据集成传统方法 科学家和IT团队人工构建并维护自定义数据管道 耗时耗用和资源密集Bunchling今日公告显示业界正在大步实现方法标准化IT团队可以少花时间维护数据基础设施并更多地专注于为科学生产数据。”

数据格式扩散 遍历不同的实验仪表和团队 一直是主要的疼痛点实验IT一次又一次解决相同的数据转换问题, 最终延缓进程开发与生物制造。”百科全书帮助解决这一普遍挑战 并增强整合适应未来使用案例

这是Benchling实验室自动化产品首创内容,支持更广泛地采用FAIR数据原则本年度晚些时候,Benchling计划以ASM和开源转换器为基础,为科学家提供完全解决方案,以无缝通信工具、取用并协调数据并产生洞察力并发高需求工具转换器第一批工具数据转换器面向板阅读器7月提供将鼓励科学家和开发者为开源库出力

有效存取和利用日积月累研发数据的能力是科学家今日面临的最大挑战物业主管Shawna Wolverton表示:「随着AI和ML的出现,Allotrope数据标准是一个伟大的基础数据转换器输入开源库实权产生时, 与平台并发 允许灵活易用 遍历端对端研发生命周期



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